Después del triunfo de los titulares, el equipo alternativo de Independiente también superó a su par de Quilmes. Fue 2-0 en el estadio Libertadores de América, por los goles de Nicolás Messiniti y Ezequiel Denis.
Gonzalo Rehak; Damián Martínez, Julián Vitale, Néstor Breitenbruch, Gustavo Toledo; Juan Sánchez Miño, Leonel Álvarez, Domingo Blanco; Emiliano Rigoni, Nicolás Messiniti y Maximiliano Meza fueron los once que paró Ariel Holan para este segundo partido.
Al igual que en el primer encuentro, los 45 minutos iniciales terminaron sin goles. Ariel Holan mandó a la cancha a Damián Albil, Diego Rodríguez, Denis y Gonzalo Asís, en lugar de Rehak, Martínez, Rigoni y Álvarez respectivamente. Tras la sucesión de cambios, el Rojo abrió la cuenta de la mano de Messiniti.
Más tarde, Meza le dejó su lugar a Lucas Lezcano. Ya con un equipo lleno de juveniles, muy distinto de aquel que había saltado a la cancha, Independiente liquidó el partido con un gol de Denis.
