Independiente participó de la Copa Argentina 2024, certamen donde llegó a los 4tos de final y fue eliminado por Vélez, el subcampeón.

Su travesía comenzó en marzo cuando enfrentó a Laferrere por los 32vos de Final, en en Lanús. Fue victoria 3-0 para el equipo de Carlos Tevez con goles de Alex Luna, Federico Mancuello y Jhonny Quiñónez.

En 16vos chocó con Juventud Unida de San Luis, también en la cancha del Granate, y con triunfo Rojo por 2-0, con tantos de Alexis Canelo y Alex Luna. En dicho partido se dio el debut profesional de Tomás Parmo, con 16 años. Además, fue el último partido del Apache por Copa Argentina.

Ya con Julio Vaccari como DT, tocó Godoy Cruz en 8vos y fue goleada 3-0 en, probablemente, el mejor partido desde su llegada a Avellaneda. Los goles fueron de Santiago Montiel, Santiago López y Diego Tarzia.

Finalmente, en 4tos, cayó ante Vélez 1-0, por un penal evitable de Joaquín Laso que Claudio Aquino cambió por gol luego de un rebote, dado que Rodrigo Rey le tapó el remate inicial. El encuentro había sido parejo, con situaciones de ambos lados, pero terminó siendo Independiente el eliminado.

Una competencia que se le hizo siempre esquiva al Rey de Copas. Habrá que ver cómo le van en el 2025.